Масаюки Уэмура проявился талант с начала карьеры в Nintendo. Он пришел в компанию в 1971 году и помогал в работе над Color TV-Game. Спустя всего несколько лет Уэмура стал главой отдела исследований и разработок японской корпорации. С 1981 года Масаюки Уэмура возглавлял команду инженеров, которые работали над легендарными консолями NES и SNES.
После ухода из Nintendo в 2004 году Уэмура работал преподавателем в Университете Рицумэйкан в Киото, где руководил обширной образовательной программой для разработчиков игр. В то же время оставался советником компании.
Причина смерти не называется.