«Сёстры Вачовски были большими фанатами Кодзимы. Кадзуми Китауэ, Кодзима, Аки Сайто (который до сих пор с ним работает) и я были в штаб-квартире Konami, когда нам позвонили, чтобы встретиться с Кодзимой. И они это сделали!»
Встреча состоялась, но тогдашний генеральный директор Konami не одобрил проект, хотя у режиссёров был свой концепт-художник и они представили идеи разработчику, поскольку Кадзуми Китауэ хотел, чтобы Хидео Кодзима сосредоточился на создании сиквела Metal Gear Solid. Это не означает, что их отношения закончились.
Бывший сотрудник Konami, пожелавший остаться анонимным, отметил, что Кодзима был очень заинтересован в игре по «Матрице», а его команда расстроилась из-за отмены сотрудничества. Позже Кодзима признавал, что «Матрица» повлияла на Metal Gear Solid 2: Sons of Liberty.