Проект начался с запроса Nintendo of America создать основную игру серии Metroid Prime. Целью было сохранить атмосферу оригинала и создать что-то новое. В центре сюжета — связь Самус Аран и антагониста Сайлокса, идея, существовавшая в студии на протяжении нескольких лет.
Основной проблемой стала смена разработчика, что потребовало перезапуска с Retro Studios. Команда признала, что у Retro не было полной структуры для разработки Metroid Prime, что потребовало перестройки процессов и работы с внешними партнерами. При этом акцент сделали на тщательной проработке игрового опыта.
Интервью также затронуло ожидания фанатов, вдохновленных The Legend of Zelda: Breath of the Wild. Команда отклонила идею открытого мира, объяснив, что свободное исследование противоречит прогрессии, основанной на способностях. Вместо этого разработан хаб с ограниченной свободой движения и транспортное средство для улучшения темпа игры.
Название игры объясняют, как «преодолением пространства и времени». Среди технических достижений — 60 кадров в секунду на Nintendo Switch и 120 кадров на Switch 2, а также плавное переключение между мышью и контроллером. В игру введены новые игровые системы, включая психические способности и транспортное средство Vi-O-La для эффективного перемещения по хабу.
Metroid Prime 4: Beyond вышла 4 декабря 2025 года для Nintendo Switch и Switch 2.