La colección Metal Gear Solid Master Collection Vol. 1 ha sido recibida fríamente por los fans. Están descontentos principalmente por la falta de mejoras gráficas y el mal acabado de los juegos. No han pasado ni tres semanas desde su lanzamiento, y los jugadores ya han corregido lo que les molestaba.
Спустя 10 часов после релиза в сети появился мод MGSResolutionPatch, позволяющий запускать MGS2 и MGS3 в разрешении 4K, а также исправляющий ошибки, связанные с кодеками и интерфейсом. Немного больше времени потребовалось другому фанату, чтобы добавить в игру поддержку сверхширокоформатных мониторов, но соответствующий патч уже доступен.
Мод Metal Gear Solid Master Collection Fix поддерживает все игры коллекции, кроме первой Metal Gear Solid (рекомендуется использовать другую версию мода), и предлагает множество исправлений. Среди них можно выделить поддержку пользовательских разрешений, оконного режима без полей, настройку чувствительности мыши в MGS3, добавление опций для регулировки анизотропной фильтрации и ограничения размера текстур.
Также на сайте Nexus появилось немало других модификаций, таких как MGS3 High Resolution Textures и MGS2 High Resolution Textures, в которых автор использовал ИИ для увеличения разрешения текстур, или MGS3MC Better Audio и MGS2MC Better Audio для улучшения ужасного качества звука в двух играх (это особенно полезно в Snake Eater).